大肠杆菌表达外源蛋白，在超声破碎的时候用超声波破碎仪便能起到很好的效果，对其他的一些细菌同样起作用，比如链霉菌，下面来详细的了解一下吧。
细菌沉淀直接加样品进行混匀、离心、煮沸后直接上样，染色脱色步骤如下：将胶放入适量的染色液微波炉里加热，将染色液换成大量的水在微波炉煮就可以了。在表达重组蛋白后超声波破碎细胞，采用冰浴 ，但是不一会就会产生大量泡沫，影响了破碎功率。
在实验过程中若产生气泡是因为探头位置没有放好，探头一定要接近底部，约1cm。功率根据仪器不同也会有所不同，因此可以观察液面，注意有波动但不要太剧烈机好。变幅杆位置摆放也要注意，听声音如果不对的话就要及时调整，另外可以从菌浓度方面考虑。在破碎时试着加大体积，强度不要超过60%。
尝试超8秒，对有些菌体蛋白来说，很难散热，导致蛋白变性产生气泡，因此停留的时间要稍长一点，这种情况多见于包涵体形式的蛋白。
使用超声波破碎仪在做大肠柑橘超声时，采用400W，超5停5的方法，效果不错，但是用在链霉菌上，似乎没有什么效果，可能死由于细胞壁组成差异造成的，因为大肠杆菌属于革兰氏阴性菌的。
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