超声波细胞粉碎仪运行是利用强超声在液体中产生空化效应，对物质进行超声处理的多功能、多用途仪器，能用于植物组织、细胞、细菌、芽胞菌种的破碎，同时可用来乳化、分离、分散、匀化、提取、脱气、清洗及加速化学反应等。
该机广泛应用于生物化学、微生物学、药物化学、表面化学、物理学、动物学、农学、医学、制药等领域教学、科研、生产。因此属于常见的超声波仪器设备，在很多行业中都有广泛使用，其中医学中的使用非常的典型，主要在疫苗的制备，细菌的杀除，某种特殊溶液的提取额，分散乳化环节的使用，简单列举以下几点：
一、制备疫苗：
制备疫苗在医学中是很常见的操作，制备疫苗的原理是将具有细胞核的病毒个体中的细胞核去掉，在这个过程中可以借助超声波细胞粉碎机来处理，一旦我们使用超声波细胞粉碎机来处理的时候，我们就会发现，处理起来特别方便，效果也很明显，我们用适当的方法将处理后的疫苗提取出来，达到制备的全部过程。
二、药物的分散效果：
有时候，在医学上我们将磷脂和胆固醇适当的混合，混合后搅拌的效果并不是很明显，我们需要更小粒子的混合，因此超声波设备无疑是我们的得力助手，用它来处理分散的药物，使得两种成分混合更加充分。
三、中草药的提取：
在中药的某些成分的提取中，我们单纯的通过煎煮、效果并不是很理想，因此选用超声波设备来完成无疑是一个明智的选择。
四、干粉的粉碎：
超声波细胞粉碎仪的原理简单来说就是将电能通过换能器转换为声能，这种能量通过液体介质（如水）而变成一个个密集的小气泡，这些小气泡迅速炸裂后所产生一定的能量，从而起到破碎细胞等物质的作用，也就是“空化效应”
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